垂体瘤在许多种群和品种的老龄大鼠中经常发生，包括Sprague-Dawley、F-344和Wistar Han大鼠。大多数垂体肿瘤被归类为嫌色腺瘤，起源于远端部。在一些报道中，垂体瘤的患病率在雌性F-344和Sprague-Dawley大鼠中更高。远端部癌的报道较少；然而，由于病理学家的分类方案不同，报告的患病率可能存在很大差异。如前所述，限制饲料热量摄入可显著降低大鼠垂体瘤的发生率。嫌色腺瘤大小不一，直径常达0.5厘米。大体看，由于明显的出血区域，肿瘤呈暗红色且柔软。它们的边界清晰，由于它们的大小，经常压迫邻近的脑组织并诱发脑积水。镜下，它们由大的多边形细胞组成，囊泡状核和嗜酸性胞浆。肿瘤的结构由由血管窦分隔的巢状、索状或片状排列的细胞组成。

最近报道的Sprague-Dawley大鼠皮质腺瘤的发生率为雄性2%，雌性5%。嗜铬细胞瘤（约85%为良性）的发病率在该种群的雄性为14%，雌性为2%，尽管与其他肿瘤一样，研究之间存在巨大差异。例如，在调查所包括的20项研究中，所有20项研究报告的良性嗜铬细胞瘤的范围从1%到28%不等。F-344大鼠肾上腺皮质瘤变发生率较低;嗜铬细胞瘤的发生率较高，雄性约32%，雌性约5%。

胰岛细胞的内分泌肿瘤在一些大鼠种群中比较常见。最近有报道称，在Sprague-Dawley大鼠种群中，雄性平均发病率为8%，雌性为3%。在16项研究中，对照组Wistar Han雄性大鼠，1217只中有36只(2%)观察到胰岛肿瘤，其中26只为腺瘤，10只为癌。同一组研究中，对照组WistarHan雌性大鼠，1217只仅有7只观察到胰岛细胞肿瘤，其中5个腺瘤和2个癌。在F-344大鼠中，发病率相似，雄性为4%，雌性为1.5%。大体上，胰岛细胞肿瘤可以是单发或多发，呈界限分明的红棕色。胰岛细胞癌与腺瘤的区别在于被膜的浸润和转移。外分泌胰腺肿瘤较少见。

大颗粒淋巴细胞白血病是F-344大鼠死亡的主要原因（Percy和Barthold, 2007），据报道发病率高达50%，平均发病率在雄性约34%，雌性约20%。恶性肿瘤的起始部位被认为是脾脏。肿瘤细胞可以移植到同一品系的大鼠身上。与小鼠白血病不同，大鼠白血病与逆转录病毒无关。诊断依据是贫血、黄疸、体重减轻和脾肿大的临床征象，白细胞计数高达40万/ml，以及不同器官恶性淋巴细胞的弥漫性浸润。